一种用于燃料电池车辆的热管理系统,包括：散热器,被配置为通过冷却水驱散从燃料电池堆生成的热量；脱矿质器,被设置在从连接在所述燃料电池堆和所述散热器之间的允许所述冷却水穿过的冷却水循环管分出的支管中；以及三通阀,被配置为包括第一端口、第二端口和第三端口,其中,所述第一端口被连接至穿过所述散热器的所述冷却水流动所沿的散热器管,所述第二端口被连接至在所述冷却水循环管内的所述散热器的入口的前面形成的旁路管,以及所述第三端口被配置为连接至所述冷却水循环管的燃料电池堆侧,以及穿过所述脱矿质器的所述冷却水流动所沿的所述脱矿质器管被连接至所述第二端口。